test_output/1y26X_M451_dinf.pdb.outCR
test_output/1y26X_M451_dinf.pdb.outCR
X   13   X   83          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   14   X   82          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   14   X   15          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   14   X   81          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   14   X   83          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   15   X   16          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   15   X   81          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   15   X   82          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   16   X   80          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   16   X   81          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   16   X   79          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   16   X   17          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   17   X   80          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   17   X   78          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   17   X   18          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   17   X   79          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   18   X   79          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   18   X   19          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   18   X   78          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   19   X   78          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   19   X   20          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   19   X   77          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   20   X   77          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   20   X   21          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   20   X   49          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   20   X   76          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   20   X   75          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   75          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   50          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   47          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   22          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   51          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   23          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   74          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   76          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   49          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   22   X   47          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   22   X   23          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   22   X   51          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   22   X   46          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   22   X   52          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   23   X   25          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   23   X   26          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   23   X   45          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   23   X   46          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   24   X   54          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   24   X   72          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   24   X   52          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   24   X   73          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   25   X   24          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   25   X   46          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   25   X   44          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   25   X   26          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   25   X   53          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   25   X   45          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   26   X   27          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   26   X   45          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   26   X   44          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   27   X   43          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   27   X   28          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   27   X   44          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   28   X   29          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   28   X   43          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   28   X   42          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   29   X   42          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   29   X   41          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   29   X   30          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   30   X   31          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   30   X   40          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   30   X   41          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   31   X   32          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   31   X   39          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   31   X   40          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   32   X   33          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   32   X   39          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   32   X   38          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   32   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   33   X   37          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   33   X   65          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   33   X   34          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   33   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   33   X   38          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   34   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   34   X   65          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   34   X   61          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   34   X   37          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   34   X   64          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   35   X   63          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   35   X   37          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   35   X   65          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   35   X   61          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   35   X   62          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   35   X   34          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   35   X   64          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   36   X   38          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   36   X   37          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   36   X   40          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   37   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   37   X   61          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   37   X   64          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   37   X   38          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   37   X   65          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   38   X   61          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   38   X   59          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   38   X   67          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   38   X   60          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   38   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   39   X   38          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   39   X   40          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   40   X   41          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   41   X   42          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   42   X   43          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   43   X   44          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   44   X   45          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   45   X   53          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   45   X   46          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   46   X   52          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   46   X   53          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   47   X   76          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   47   X   50          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   47   X   49          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   47   X   51          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   47   X   52          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   48   X   47          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   49   X   76          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   49   X   48          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   50   X   49          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   50   X   51          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   50   X   76          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   50   X   75          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   51   X   74          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   51   X   52          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   51   X   75          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   52   X   53          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   52   X   74          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   54   X   72          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   54   X   25          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   54   X   53          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   54   X   55          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   54   X   71          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   55   X   56          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   55   X   72          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   55   X   70          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   55   X   71          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   56   X   71          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   56   X   58          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   56   X   57          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   56   X   70          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   57   X   58          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   57   X   69          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   57   X   36          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   57   X   70          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   57   X   68          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   58   X   69          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   58   X   59          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   58   X   68          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   58   X   67          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   59   X   67          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   59   X   60          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   59   X   68          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   60   X   67          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   60   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   60   X   61          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   61   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   61   X   64          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   61   X   62          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   61   X   65          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   62   X   63          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   63   X   64          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   63   X   34          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   64   X   65          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   65   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   67   X   68          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   68   X   69          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   69   X   70          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   70   X   71          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   71   X   72          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   72   X   73          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   73   X   74          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   73   X   52          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   74   X   23          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   74   X   22          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   74   X   75          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   75   X   77          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   75   X   76          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   76   X   77          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   77   X   78          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   78   X   79          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   79   X   80          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   80   X   81          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   81   X   82          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   81   X   83          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   82   X   83          bp G C                  WW_cis   1.0000

test_output/1Y26_dinf.pdb.outCR
X   13   X   82          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   13   X   83          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   13   X   14          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   14   X   82          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   14   X   15          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   14   X   81          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   14   X   83          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   15   X   16          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   15   X   80          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   15   X   81          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   15   X   82          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   16   X   80          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   16   X   81          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   16   X   79          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   16   X   17          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   17   X   80          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   17   X   78          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   17   X   18          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   17   X   79          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   18   X   79          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   18   X   19          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   18   X   78          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   19   X   76          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   19   X   78          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   19   X   20          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   19   X   77          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   20   X   77          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   20   X   21          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   20   X   49          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   20   X   76          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   20   X   75          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   75          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   50          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   47          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   22          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   74          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   76          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   21   X   49          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   22   X   47          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   22   X   23          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   22   X   53          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   22   X   51          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   22   X   46          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   22   X   52          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   23   X   24          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   23   X   45          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   23   X   46          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   23   X   25          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   23   X   53          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   24   X   54          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   24   X   72          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   24   X   73          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   25   X   24          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   25   X   46          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   25   X   44          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   25   X   26          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   25   X   53          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   25   X   45          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   26   X   27          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   26   X   45          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   26   X   43          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   26   X   44          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   27   X   43          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   27   X   28          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   27   X   44          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   27   X   42          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   28   X   29          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   28   X   43          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   28   X   42          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   28   X   41          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   29   X   42          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   29   X   41          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   29   X   30          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   30   X   39          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   30   X   31          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   30   X   40          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   30   X   41          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   31   X   32          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   31   X   39          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   31   X   40          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   32   X   33          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   32   X   39          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   32   X   38          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   33   X   65          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   33   X   37          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   33   X   34          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   33   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   33   X   38          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   34   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   34   X   65          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   34   X   37          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   34   X   64          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   35   X   63          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   35   X   37          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   35   X   61          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   35   X   62          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   35   X   34          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   35   X   64          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   37   X   60          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   37   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   37   X   61          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   37   X   64          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   37   X   38          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   37   X   65          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   37   X   36          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   38   X   39          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   38   X   61          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   38   X   59          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   38   X   67          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   38   X   60          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   38   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   39   X   40          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   40   X   41          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   41   X   42          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   42   X   43          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   43   X   44          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   44   X   45          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   45   X   53          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   45   X   46          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   46   X   47          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   46   X   53          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   46   X   52          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   47   X   50          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   47   X   49          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   47   X   51          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   47   X   52          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   49   X   50          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   49   X   76          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   49   X   77          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   49   X   48          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   50   X   51          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   50   X   76          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   50   X   75          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   51   X   74          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   51   X   52          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   51   X   49          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   51   X   75          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   52   X   53          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   52   X   74          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   53   X   24          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   54   X   72          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   54   X   25          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   54   X   53          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   54   X   55          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   54   X   71          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   55   X   56          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   55   X   72          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   55   X   70          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   55   X   71          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   55   X   25          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   56   X   57          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   56   X   71          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   56   X   70          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   56   X   69          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   57   X   69          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   57   X   58          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   57   X   70          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   57   X   68          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   58   X   69          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   58   X   59          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   58   X   68          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   58   X   67          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   59   X   67          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   59   X   60          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   59   X   68          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   60   X   67          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   60   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   60   X   61          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   61   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   61   X   64          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   61   X   65          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   62   X   63          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   62   X   61          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   63   X   64          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   63   X   34          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   64   X   65          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   65   X   66          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   66   X   67          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   67   X   68          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   68   X   69          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   69   X   70          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   70   X   71          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   71   X   72          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   72   X   25          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   73   X   74          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   73   X   52          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   74   X   75          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   75   X   76          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   76   X   77          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   77   X   78          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   78   X   79          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   79   X   80          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   80   X   81          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   81   X   82          bp G C                  WW_cis   1.0000
X   82   X   83          bp G C                  WW_cis   1.0000

compare:
1y26X_M451_dinf.pdb.outCR     1Y26_dinf.pdb.outCR

reference vs prediction:
   WC    ref   193   pred-match   171
  nWC    ref     0   pred-match     0
stack    ref     0   pred-match     0

prediction vs reference:   WC   pred   195    ref-match   171
  nWC   pred     0    ref-match     0
stack   pred     0    ref-match     0

for all motifs:nref  193,  nchkTP  171,  nFN   22
nchk  195,  nrefTP  171,  nFP   24


summary:
inf_all      0.881
inf_stack    0.000
inf_WC       0.881
inf_nWC      0.000
SNS_WC       0.886
PPV_WC       0.877
SNS_nWC      0.000
PPV_nWC      0.000

