Input/output utilities
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Variant Call Format (VCF)
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.. autofunction:: allel.read_vcf
.. autofunction:: allel.vcf_to_npz
.. autofunction:: allel.vcf_to_hdf5
.. autofunction:: allel.vcf_to_zarr
.. autofunction:: allel.vcf_to_dataframe
.. autofunction:: allel.vcf_to_csv
.. autofunction:: allel.vcf_to_recarray
.. autofunction:: allel.iter_vcf_chunks
.. autoclass:: allel.ANNTransformer
.. autofunction:: allel.write_vcf

GFF3
----

.. autofunction:: allel.gff3_to_dataframe
.. autofunction:: allel.gff3_to_recarray
.. autofunction:: allel.iter_gff3

Fasta
-----

.. autofunction:: allel.write_fasta

